Biopython - 安装

本节介绍如何在您的机器上安装 Biopython。 它非常容易安装，不会超过五分钟。

第 1 步 − 验证 Python 安装

Biopython 旨在与 Python 2.5 或更高版本一起使用。 因此，必须先安装 python。 在命令提示符下运行以下命令 −

> python --version

定义如下 −

如果安装正确，它会显示 python 的版本。 否则，下载最新版本的 python，安装它，然后再次运行命令。

第 2 步 − 使用 pip 安装 Biopython

在所有平台上从命令行使用 pip 很容易安装 Biopython。 输入以下命令 −

> pip install biopython

将在您的屏幕上看到以下响应 −

用于更新旧版本的 Biopython −

> pip install biopython –-upgrade

将在您的屏幕上看到以下响应 −

执行此命令后，旧版本的 Biopython 和 NumPy（Biopython 依赖于它）将在安装最新版本之前被删除。

第 3 步 − 验证 Biopython 安装

现在，您已经成功地在您的机器上安装了 Biopython。 要验证 Biopython 是否已正确安装，请在 python 控制台上键入以下命令 −

它显示了 Biopython 的版本。

替代方式 − 使用源安装 Biopython

要使用源代码安装 Biopython，请按照以下说明操作 −

从以下链接下载最新版本的 Biopython − https://biopython.org/wiki/Download

截至目前，最新版本是biopython-1.72。

下载文件并解压缩压缩存档文件，移至源代码文件夹并键入以下命令 −

> python setup.py build

这将从下面给出的源代码构建 Biopython −

现在，使用以下命令测试代码 −

> python setup.py test

最后，使用下面的命令安装 −

> python setup.py install